Örtü sistemi, hayvan anatomisinde sıklıkla bir hayvanın en büyük organ sistemidir. Deri, saç, tüyler, pullar, tırnaklar ve deri bezleri ile onların ürünlerini (ter gibi) kapsar. Dış çevre ile vücudu ayırır ve vücudu dış çevreye karşı korur.

Botanikte ise örtü sistemi bir ovülün örtüsüne verilen isimdir.

Sözcük Latince integumentum yani "kaplamak/örtmek"ten gelir.