CKAP5

Homo sapiens türünde protein kodlayıcı gen

Hücre iskeletine bağlı protein 5, insanlarda CKAP5 geni tarafından kodlanan mikrotübüle bağlı bir proteindir.[4][5][6] Xenopus'un XMAP215 proteininin[7] homologudur ve ch-Tog olarak da bilinir.

CKAP5
Uygun yapılar
PDBOrtolog araması: PDBe RCSB
Tanımlayıcılar
Başka adlarCKAP5, CHTOG, MSPS, TOG, TOGp, ch-TOG, hücre iskeleti ilişkili protein 5
Dış kimliklerOMIM: 611142 MGI: 1923036 HomoloGene: 8844 GeneCards: CKAP5
Gen yerleşimi (İnsan)
11. Kromozom (insan)
Krom.11. Kromozom (insan)[1]
11. Kromozom (insan)
CKAP5 için genom yerleşimi
CKAP5 için genom yerleşimi
Bant11p11.2Başlangıç46,743,048 [1]
Bitiş46,846,308 [1]
RNA ekspresyonu deseni
Daha çok ekspresyon verisi başvurusu
Ortologlar
TürlerİnsanFare
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (mRNA)

NM_014756
NM_001008938

NM_001165989
NM_029437

RefSeq (protein)

NP_001008938
NP_055571

NP_001159461
NP_083713

Yerleşim (UCSC)Krom. 11: 46.74 – 46.85 Mbn/a
PubMed araması[2][3]
Vikiveri
İnsan'ı Gör/DüzenleFare'yi Gör/Düzenle

Bunun, en az iki farklı rollere sahiptir iğ ipliği oluşumunda en az iki ayrı rolü vardır: MCAK (KIF2C) aracılığıyla depolimerizasyondan kinetokor mikrotübüllerini korur ve MCAK etkinliğinden bağımsız bir işlev olan sentrozomal mikrotübül birleştiriminde cH-Tog önemli bir rol oynar.[8]

Etkileşimler

değiştir

CKAP5'in TACC1 ile etkileşime girdiği gösterilmiştir.[9][10]

Kaynakça

değiştir
  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000175216 - Ensembl, May 2017
  2. ^ "İnsan PubMed Başvurusu:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine. 
  3. ^ "Fare PubMed Başvurusu:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine. 
  4. ^ "Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. III. The coding sequences of 40 new genes (KIAA0081-KIAA0120) deduced by analysis of cDNA clones from human cell line KG-1". DNA Res. 2 (1). Jul 1995. ss. 37-43. 
  5. ^ "Characterization of the cDNA and pattern of expression of a new gene over-expressed in human hepatomas and colonic tumors". Eur. J. Biochem. 234 (2). Feb 1996. ss. 406-13. 
  6. ^ "Entrez Gene: CKAP5 cytoskeleton associated protein 5". 5 Aralık 2010 tarihinde kaynağından arşivlendi. 
  7. ^ "TOGp, the human homolog of XMAP215/Dis1, is required for centrosome integrity, spindle pole organization, and bipolar spindle assembly". Mol. Biol. Cell. 15 (4). 2004. ss. 1580-90. 
  8. ^ "MCAK-independent functions of ch-Tog/XMAP215 in microtubule plus-end dynamics". Mol. Cell. Biol. 28 (23). 2008. ss. 7199-211. 
  9. ^ "TACC1-chTOG-Aurora A protein complex in breast cancer". Oncogene. 22 (50). Nov 2003. ss. 8102-16. 
  10. ^ "Interaction of the transforming acidic coiled-coil 1 (TACC1) protein with ch-TOG and GAS41/NuBI1 suggests multiple TACC1-containing protein complexes in human cells". Biochem. J. 363 (Pt 1). Apr 2002. ss. 195-200. 

Dış bağlantılar

değiştir

Konuyla ilgili yayınlar

değiştir
  • Basto R, Gergely F, Draviam VM, Ohkura H, Liley K, Raff JW (2007). "Hsp90 is required to localise cyclin B and Msps/ch-TOG to the mitotic spindle in Drosophila and humans". J. Cell Sci. 120 (Pt 7). ss. 1278-87. doi:10.1242/jcs.000604. PMID 17376965. 
  • Kosturko LD, Maggipinto MJ, D'Sa C, Carson JH, Barbarese E (2005). "The microtubule-associated protein tumor overexpressed gene binds to the RNA trafficking protein heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A2". Mol. Biol. Cell. 16 (4). ss. 1938-47. doi:10.1091/mbc.E04-08-0709. PMC 1073673 $2. PMID 15703215. 
  • Beausoleil SA, Jedrychowski M, Schwartz D, Elias JE, Villén J, Li J, Cohn MA, Cantley LC, Gygi SP (2004). "Large-scale characterization of HeLa cell nuclear phosphoproteins". Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 101 (33). ss. 12130-5. doi:10.1073/pnas.0404720101. PMC 514446 $2. PMID 15302935. 
  • Cassimeris L, Morabito J (2004). "TOGp, the human homolog of XMAP215/Dis1, is required for centrosome integrity, spindle pole organization, and bipolar spindle assembly". Mol. Biol. Cell. 15 (4). ss. 1580-90. doi:10.1091/mbc.E03-07-0544. PMC 379257 $2. PMID 14718566. 
  • Conte N, Delaval B, Ginestier C, Ferrand A, Isnardon D, Larroque C, Prigent C, Séraphin B, Jacquemier J, Birnbaum D (2003). "TACC1-chTOG-Aurora A protein complex in breast cancer". Oncogene. 22 (50). ss. 8102-16. doi:10.1038/sj.onc.1206972. PMID 14603251. 
  • Gergely F, Draviam VM, Raff JW (2003). "The ch-TOG/XMAP215 protein is essential for spindle pole organization in human somatic cells". Genes Dev. 17 (3). ss. 336-41. doi:10.1101/gad.245603. PMC 195983 $2. PMID 12569123. 
  • Nakayama M, Kikuno R, Ohara O (2002). "Protein-protein interactions between large proteins: two-hybrid screening using a functionally classified library composed of long cDNAs". Genome Res. 12 (11). ss. 1773-84. doi:10.1101/gr.406902. PMC 187542 $2. PMID 12421765. 
  • Lauffart B, Howell SJ, Tasch JE, Cowell JK, Still IH (2002). "Interaction of the transforming acidic coiled-coil 1 (TACC1) protein with ch-TOG and GAS41/NuBI1 suggests multiple TACC1-containing protein complexes in human cells". Biochem. J. 363 (Pt 1). ss. 195-200. doi:10.1042/0264-6021.3630195. PMC 1222467 $2. PMID 11903063. 
  • Bonaldo MF, Lennon G, Soares MB (1996). "Normalization and subtraction: two approaches to facilitate gene discovery". Genome Res. 6 (9). ss. 791-806. doi:10.1101/gr.6.9.791. PMID 8889548. 
  • Nakamura S, Grigoriev I, Nogi T, Hamaji T, Cassimeris L, Mimori-Kiyosue Y (2012). "Dissecting the nanoscale distributions and functions of microtubule-end-binding proteins EB1 and ch-TOG in interphase HeLa cells". PLoS ONE. 7 (12). ss. e51442. doi:10.1371/journal.pone.0051442. PMC 3520847 $2. PMID 23251535. 
  • Zanic M, Widlund PO, Hyman AA, Howard J (2013). "Synergy between XMAP215 and EB1 increases microtubule growth rates to physiological levels". Nat. Cell Biol. 15 (6). ss. 688-93. doi:10.1038/ncb2744. PMID 23666085.