'''Endospor boyama '''bakteri sınıflandırmasında kullanışlı olabilen, bakteri numunesinde [[endospor]] varlığını tanımlamak için [[bakteriyoloji]]<nowiki/>de kullanılan teknik.<ref name="Hussey">{{Web kaynağı | last = Hussey | last2author1 = Zayaitz, Anne | author2 = Zayaitz, Anne | first = Marise | date = 2011-09-29 | title = Endospore Stain Protocol | url = http://www.microbelibrary.org/component/resource/laboratory-test/3112-endospore-stain-protocol | URL = http://www.microbelibrary.org/component/resource/laboratory-test/3112-endospore-stain-protocol | access-date = 2012-03-06 | accessdate = 2012-03-06 | publisher = [[American Society for Microbiology]] | arşivurl = http://web.archive.org/web/20160518071610/http://www.microbelibrary.org:80/component/resource/laboratory-test/3112-endospore-stain-protocol | arşivtarihi = 18 Mayıs 2016}}</ref> Bakterilerin içinde, endosporlar extrem koşullarda yaşama devam etmek için hayli koruyucu bir doğaya sahiptirler. Fakat bu koruyucu doğa normal yollar ile boyamayı zorlaştırır. Endosporları boyamak için kullanılan methodlar arasında [[Schaeffer–Fulton stain|Schaeffer–Fulton boyaması]] ve [[Moeller stain|Moeller boyaması]] mevcuttur. Spor boyamak için kullanılacak iyi boyalardan biri malakit (bakır taşı) yeşilidir. Sporların yoğun yapısından dolayı boyama çok uzun sürer, bu süreçte zaman mordan olarak görev alır. Bu ayrımsal boyama yapıldığında bakteri taşıyan slayt malakit yeşilin içerisine en az 30 dakika batırılmalıdır. Su renksizleştirici rolünü oynar. Vejetatif hücreleri farklılaştırmak için 0.5% safranin karşıtboyası kullanılır. Farklı endospor türleri mevcuttur. Bu boyama metodu boyanan ''Mycobacterium'' olduğunda canlının kalın yapısı engeline takılır. Bazı hücreler yeşile boyanır ve sporların varlığında dair pozitif sinyal verir ama aslında bu bakteriler spor üretmezler.
