Kullanıcı:Albatu 02/Reporter gene

Olarak moleküler biyoloji, bir raportör geni (genellikle sadece raportör) a, gen araştırmacılar eklemek bu düzenleyici dizi de ilgi konusu başka gen bakteri, hücre kültürü, hayvan ya da bitki. Bu tür genler, kendilerini ifade eden organizmalara kazandırdıkları özellikler kolayca tanımlanıp ölçüldüğünden veya seçilebilir belirteçler oldukları için muhabir olarak adlandırılır. Haberci genler, genellikle belirli bir genin hücre veya organizma popülasyonu tarafından alınıp alınmadığının veya ifade edilip edilmediğinin bir göstergesi olarak kullanılır.

Yaygın muhabir genleri

Gen ifade tahlilleri

Raportör genler, normalde nicel olarak test edilmesi zor olan ilgili bir genin ekspresyonunu test etmek için kullanılabilir. ^[1] Raportör genler, hücre kültürü veya organizma üzerinde çok az belirgin veya ani etkisi olan bir protein üretebilir. İdeal olarak, ilgilenilen genin ifadesinin bir sonucu olarak raportör gen tahlilini izole edebilmek için doğal genomda bulunmazlar. ^[1] ^[2]

Raportör genleri aktive etmek için, bir gen füzyonu yaratmak için doğrudan ilgili gene bağlandıkları yerde yapısal olarak ifade edilebilirler. ^[3] Bu yöntem, iki genin aynı promotör elementler altında olduğu ve tek bir haberci RNA molekülüne kopyalandığı <i id="mwnQ">cis</i> etkili elementlerin kullanımına bir örnektir. mRNA daha sonra proteine çevrilir. Her iki proteinin de aktif yapılarına uygun şekilde katlanabilmesi ve kaynaşmasına rağmen substratları ile etkileşime girebilmesi önemlidir. DNA yapısının oluşturulmasında, esnek bir polipeptit bağlayıcı bölgesini kodlayan bir DNA segmenti genellikle dahil edilir, böylece raportör ve gen ürünü birbiriyle yalnızca minimum düzeyde etkileşime girer. ^[4] ^[5] Raportör genler, büyüme sırasında indüksiyon yoluyla da ifade edilebilir. Bu durumlarda, raportör geni ifade etmek için transkripsiyon faktörleri gibi <i id="mwqQ">trans-</i> etkili elemanlar kullanılır. ^[6] ^[7]

Promoter tahlilleri

Raportör genler, bir hücre veya organizmada belirli bir promotörün aktivitesini test etmek için kullanılabilir. ^[8] Bu durumda ayrı bir "ilgi geni" yoktur; raportör gen basitçe hedef promotörün kontrolü altına yerleştirilir ve raportör gen ürününün aktivitesi nicel olarak ölçülür. Sonuçlar normal olarak, güçlü gen ekspresyonunu indüklediği bilinen bir "konsensüs" promotörü altındaki aktiviteye göre rapor edilir. ^[9]

Diğer kullanımlar

Raportör genlerin büyük ölçekte daha karmaşık bir kullanımı, in vivo olarak birbirleriyle doğal olarak etkileşime giren proteinleri tanımlamayı amaçlayan ikili hibrit taramadır . ^[10]

Ayrıca bakınız

GUS raporlayıcı sistem

Referanslar

Dış bağlantılar

Raportör genler hakkında araştırma vurguları ve güncel bilgiler.
β-Galaktosidaz (lacZ) Aktivitesi için Bütün Fare Embriyolarının Boyanması

[[Kategori:Genler]] [[Kategori:Moleküler biyoloji]]

^ ^a ^b Prasad, Godavarthi B.K.S.; Bisen, Prakash S., (Ed.) (2010), "Reporter Gene", Molecular Diagnostics: Promises and Possibilities (İngilizce), Springer Netherlands, ss. 71–84, doi:10.1007/978-90-481-3261-4_5, ISBN 978-90-481-3261-4 Birden fazla editör-name-list parameters kullanıldı (yardım); r |ad1= eksik |soyadı1= (yardım)
^ "Introduction to Reporter Gene Assays". YouTube. October 22, 2014. Erişim tarihi: March 21, 2020.
^ de Jong (2015). Maler, Oded; Halász, Ádám; Dang, Thao; Piazza, Carla (Ed.). "Fluorescent Reporter Genes and the Analysis of Bacterial Regulatory Networks". Hybrid Systems Biology. Lecture Notes in Computer Science (İngilizce). Springer International Publishing. 7699: 27–50. doi:10.1007/978-3-319-27656-4_2. ISBN 978-3-319-27656-4.
^ Spector (2006-12-01). "Constructing and Expressing GFP Fusion Proteins". CSH Protocols. 2006 (7): pdb.prot4649. doi:10.1101/pdb.prot4649. PMID 22484672.
^ Chen (2013-10-15). "Fusion Protein Linkers: Property, Design and Functionality". Advanced Drug Delivery Reviews. 65 (10): 1357–1369. doi:10.1016/j.addr.2012.09.039. ISSN 0169-409X. PMC 3726540 $2. PMID 23026637.
^ "Chapter Nine - Design, cloning and characterization of transcription factor-based inducible gene expression systems", Methods in Enzymology, Chemical and Synthetic Biology Approaches To Understand Cellular Functions - Part A, 621, Academic Press, 2019-01-01, ss. 153–169, doi:10.1016/bs.mie.2019.02.018, PMID 31128776, erişim tarihi: 2019-12-16 Birden fazla editör-name-list parameters kullanıldı (yardım); r |ad1= eksik |soyadı1= (yardım)
^ Kallunki (2019-07-30). "How to Choose the Right Inducible Gene Expression System for Mammalian Studies?". Cells. 8 (8): 796. doi:10.3390/cells8080796. ISSN 2073-4409. PMC 6721553 $2. PMID 31366153.
^ Jugder (2016-07-26). "Construction and use of aCupriavidus necatorH16 soluble hydrogenase promoter (PSH) fusion togfp(green fluorescent protein)". PeerJ (İngilizce). 4: e2269. doi:10.7717/peerj.2269. ISSN 2167-8359. PMC 4974937 $2. PMID 27547572.
^ "Luciferase assay to study the activity of a cloned promoter DNA fragment". Gene Regulation. Methods in Molecular Biology (Clifton, N.J.). 977. 2013. ss. 65–78. doi:10.1007/978-1-62703-284-1_6. ISBN 978-1-62703-283-4. ISSN 1940-6029. PMID 23436354.
^ Brückner (2009-06-18). "Yeast Two-Hybrid, a Powerful Tool for Systems Biology". International Journal of Molecular Sciences. 10 (6): 2763–2788. doi:10.3390/ijms10062763. ISSN 1422-0067. PMC 2705515 $2. PMID 19582228.

[:0-1] Prasad, Godavarthi B.K.S.; Bisen, Prakash S., (Ed.) (2010), "Reporter Gene", Molecular Diagnostics: Promises and Possibilities (İngilizce), Springer Netherlands, ss. 71–84, doi:10.1007/978-90-481-3261-4_5, ISBN 978-90-481-3261-4 Birden fazla editör-name-list parameters kullanıldı (yardım); r |ad1= eksik |soyadı1= (yardım)

[2] "Introduction to Reporter Gene Assays". YouTube. October 22, 2014. Erişim tarihi: March 21, 2020.

[3] Jong (2015). Maler, Oded; Halász, Ádám; Dang, Thao; Piazza, Carla (Ed.). "Fluorescent Reporter Genes and the Analysis of Bacterial Regulatory Networks". Hybrid Systems Biology. Lecture Notes in Computer Science (İngilizce). Springer International Publishing. 7699: 27–50. doi:10.1007/978-3-319-27656-4_2. ISBN 978-3-319-27656-4.

[4] Spector (2006-12-01). "Constructing and Expressing GFP Fusion Proteins". CSH Protocols. 2006 (7): pdb.prot4649. doi:10.1101/pdb.prot4649. PMID 22484672.

[5] Chen (2013-10-15). "Fusion Protein Linkers: Property, Design and Functionality". Advanced Drug Delivery Reviews. 65 (10): 1357–1369. doi:10.1016/j.addr.2012.09.039. ISSN 0169-409X. PMC 3726540 $2. PMID 23026637.

[6] "Chapter Nine - Design, cloning and characterization of transcription factor-based inducible gene expression systems", Methods in Enzymology, Chemical and Synthetic Biology Approaches To Understand Cellular Functions - Part A, 621, Academic Press, 2019-01-01, ss. 153–169, doi:10.1016/bs.mie.2019.02.018, PMID 31128776, erişim tarihi: 2019-12-16 Birden fazla editör-name-list parameters kullanıldı (yardım); r |ad1= eksik |soyadı1= (yardım)

[7] Kallunki (2019-07-30). "How to Choose the Right Inducible Gene Expression System for Mammalian Studies?". Cells. 8 (8): 796. doi:10.3390/cells8080796. ISSN 2073-4409. PMC 6721553 $2. PMID 31366153.

[8] Jugder (2016-07-26). "Construction and use of aCupriavidus necatorH16 soluble hydrogenase promoter (PSH) fusion togfp(green fluorescent protein)". PeerJ (İngilizce). 4: e2269. doi:10.7717/peerj.2269. ISSN 2167-8359. PMC 4974937 $2. PMID 27547572.

[9] "Luciferase assay to study the activity of a cloned promoter DNA fragment". Gene Regulation. Methods in Molecular Biology (Clifton, N.J.). 977. 2013. ss. 65–78. doi:10.1007/978-1-62703-284-1_6. ISBN 978-1-62703-283-4. ISSN 1940-6029. PMID 23436354.

[10] Brückner (2009-06-18). "Yeast Two-Hybrid, a Powerful Tool for Systems Biology". International Journal of Molecular Sciences. 10 (6): 2763–2788. doi:10.3390/ijms10062763. ISSN 1422-0067. PMC 2705515 $2. PMID 19582228.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]