1998–99 NBA sezonu profesyonel basketbol ligi NBA'in 53. sezonudur. Sezon sonunda San Antonio Spurs takımı, New York Knicks'i 1999 NBA Finalleri'nde 4-1 ile geçerek ilk NBA şampiyonluğunu kazanmıştır. National Basketball Players Association (NBA Basketbol Oyuncuları Birliği) tarafından alınan lokavt kararı sonucu lig planlanan zamanda başlayamamış, NBA ile Birlik arasında varılan 6 yıllık anlaşma sonrası ancak 5 Şubat 1999'da başlayabilmiştir. Fikstür bunun üzerine yeniden düzenlenmiş, tüm 29 takımın normal sezondaki maç sayısı 50'ye indirilmiş ve playoffa 16 takım çıkarılmıştır.
- NBA ve Oyuncular Birliği uzun süren tartışmalar ve görüşmelerden sonra toplu iş sözleşmelesini 18 Ocak 1999'da imzaladı.
- NBA All-Star Maçı, lokavt nedeniyle bu sezon düzenlenmedi.
- Lokavt nedeniyle, sezon kısaltıldı ve bazı takımlar kendi aralarında maç yapmadı ve her takım normal sezonda 50 maç yaptı.
- Los Angeles Lakers, Great Western Forum'daki son sezonunu geçirdi.
- Indiana Pacers, Market Square Arena'daki son maçına çıktı.
- Denver Nuggets, McNichols Sports Arena'daki son maçına çıktı.
- Toronto Raptors, Air Canada Centre'daki ilk sezonuna çıktı.
- New York Knicks, normal sezonu 8. sırada bitirip, NBA Playofflarında birinci sıradaki takımı eleyen ikinci takım oldu. Yine Knicks sekizinci sıradan NBA Finali'ne çıkan ilk takım oldu.
- San Antonio Spurs, NBA Finallerinde maç 2'de 39,554 seyirci ile en çok seyircili maça ev sahipliği yaptı. Maç 1'de ise 39,514 seyirci vardı.
- Spurs, eski Aba Basketbol Ligi'nden lige katılan takımlar arasında şampiyon olan ilk takım oldu.
- 1954–55 NBA sezonundan sonra ilk kez (hücum süresinin uygulanmaya başladığı sezon), hiçbir takım maç başına 100 sayı ortalaması tutturamadı.
- Atlanta Hawks, Philips Arena'nın inşası sürdüğü dönem için Georgia Dome'da iç saha maçlarını oynadı. Ayrıca bu sezon Hawks'ın 2007-08 NBA sezonuna kadar playoffa çıktığı son sezon oldu.
1998-99 NBA istatistik liderleri
değiştir