Heisenberg [[Klasik müzik|klasik müziğ]]<nowiki/>i seviyordu ve başarılı bir piyanistti. Müziğe olan ilgisi eşiyle tanışmasına yol açtı. Ocak 1937'de Heisenberg, Elisabeth Schumacher ile özel bir müzik resitalinde tanıştı. Babababba Elisabeth, ünlü bir Berlin ekonomi profesörünün kızıydı. Heisenberg 29 Nisan'da onunla evlendi. 1938 yılında çift yumurta ikizleri Maria ve Wolfgang dünyaya geldi. İlerideki 12 yıl içinde Barbara, Christine, Jochen, Martin ve Verena adında 10 çocuğu daha oldu. Jochen, New Hampshire Üniversitesi'nde [[fizik]] profesörü oldu.<ref>{{Web kaynağı|url=https://www.researchgate.net/profile/Ion-Baianu/publication/233398904_Quantum_Algebraic_Topology_and_Quantum_Operator_Algebra/links/09e4150a30761e7f52000000/Quantum-Algebraic-Topology-and-Quantum-Operator-Algebra.pdf#page=610|başlık=Quantum-Algebraic-Topology-and-Quantum-Operator-Algebra}}</ref>
