21 Mayıs 1527 tarihinde doğan II. Felipe, (Philip) I. Philip ve Kastilyalı Joanna'nın büyük oğlu Kutsal Roma Cermen İmparatoru ve İspanya kralı V.Karl (Kendisi Türk dünyasında daha çok "Şarlken"olarak) bilinir.)ile Portekiz Kralı I.Manuel ve Aragonlu Maria'nın (Aragonlu Maria Kastilyalı Joanna'nın öz kız kardeşidir. Bu da II. Philip'in ebeveynlerinin teyze çocukları olduğu anlamına gelir. II.Philip'in mensup olduğu Habsburg Hanedanı'nın üyeleri arasında yakın akrabalarla evlilik yaygın bir durumdu. Nitekim Philip ilk eşi Prenses Maria Manuela'nın hem anne hem baba tarafından birinci dereceden kuzeni ve dördüncü eşi Avusturyalı Anna'nın öz dayısıdır.) kızı Portekizli Isabella'in hayatta kalan tek erkek çocuğuydu. İmparatoriçe Isabella ve eşinin diğer erkek çocuklarından Ferdinand ve Juan henüz çok küçükken vefat etmiş,iki bahtsız prensin Philip hariç Isabella'den olan meşru erkek kardeşleri de ya ölü doğmuş ya da gebelik düşükle sonuçlanmıştır.Bu gebeliklerden sonuncusu Isabella'in hayatının da sonu olmuş ve Philip on ikinci doğum gününden yaklaşık bir ay önce annesini kaybetmiştir.Garip evlilikler ve ölümlerle babası bütün aile mirasını bünyesinde toplamıştı. 1554 yılında İngiltere'nin [[Katolik]] kraliçesi Mary Tudor'la evlenerek [[Birleşik Krallık]] üzerinde de söz sahibi oldu. 1556 yılında V. Karl tahttan çekilince, II. Felipe İspanya kralı, ve amcası Kutsal Roma-Cermen İmparatoru oldu. II. Felipe Katolik olduğundan dolayı, Protestanlardan nefret ediyordu. Tahta geçer geçmez, İspanya'daki bütün protestanların öldürülmesini emretti. 18 bin.000 insan bu dönemde idam edildi. 1558 yılında [[I. Mary]] ölünce İngiltere üzerindeki nüfuzunu kaybetti. Bu sefer İngiltere'nin yeni protestan kraliçesi [[I. Elizabeth]]'le evlenmek istedi ama başarılı olamadı.
