Chargaff kuralları: Revizyonlar arasındaki fark
[kontrol edilmiş revizyon] | [kontrol edilmiş revizyon] |
İçerik silindi İçerik eklendi
Khutuck Bot (mesaj | katkılar) k Bot: Kaynak ve içerik düzenleme (hata bildir) |
Khutuck Bot (mesaj | katkılar) k Bot v3: Kaynak ve içerik düzenleme (hata bildir) |
||
1. satır:
'''Chargaff kuralları''', Avusturyalı biyokimyacı [[Edwin Chargaff]] tarafından 1949-1951'de yayımlanan, [[DNA]]'daki çeşitli [[nükleobaz|azotlu bazların]] miktarları arasındaki ilişkileri ifade eden empirik kurallardır.<ref name="Elson1952">{{Dergi kaynağı|doi=10.1007/BF02170221 |yazar=Elson D, Chargaff E |yıl=1952 |başlık=On the deoxyribonucleic acid content of sea urchin gametes |dergi=Experientia |cilt=8 |sayı=4 |sayfalar=
Chargaff'ın çalışmasına kadar "tetranükleotit" teorisi hakimdi, bu teoriye göre DNA dört farklı azotlu bazın ( [[adenin]], [[timin]], [[guanin]] ve [[sitozin]]) tekrar eden birimlerinden oluşmaktaydı. Chargaff ve yardımcıları DNA nükleotitlerini [[kâğıt kromatografisi]] ile ayrıştırıp farklı tiplerden nükleotitlerin miktarlarını ölçtüler. Eğer dört baz tekrar eden birimler içinde olsaydı oranlarının eşit olması beklenirdi, oysa ölçümler bunu doğrulamadı. Chargaff tarafından bulunan ilişkiler aşağıdaki gibiydi:<ref>Molecular Biology / history of biology since the beginning of XX century to the present day. М.: Наука. Moscow: Nauka. 1975. 1975. sayfa 454 - 454</ref>
9. satır:
Ancak, farklı biyolojik [[tür]]lerden elde edilen DNA'daki (A + T): (G + C) oranı farklıydı. Bazı türlerde A+T'ler hakimdi, bazılarında ise G+C'ler.
Chargaff'ın kuralları, [[James Watson]] ve [[Francis Crick]]'ın önerdiği üç boyutlu DNA yapısının doğruluğunu destekleyici bir bilgi olarak belirtilmiştir.<ref name=FWPUB>{{Dergi kaynağı |yazar=Watson J.D. ve Crick F.H.C. |pmid=13054692 |doi=10.1038/171737a0 |url=http://www.nature.com/nature/dna50/watsoncrick.pdf |başlık=A Structure for Deoxyribose Nucleic Acid |dergi=Nature |cilt=171 |sayfalar=
== DNA'daki bazların yüzdeleri ==
Aşağıdaki tablo Erwin Chargaff's 1952 verilerinden bazı örnekler sunar. Listelenmekte olan çeşitli organizmaların baz bileşimleri Chargaff'ın kurallarının desteklemektedir.<ref name="Bansal2003">{{Dergi kaynağı|yazar=Bansal M |başlık=DNA structure: Revisiting the Watson-Crick double helix |dergi=Current Science |cilt=85 |sayı=11 |sayfalar=
{| border="0" align="center" style="border: 1px solid #999; background-color:#FFFFFF"
|-align="left" bgcolor="#CCCCCC"
41. satır:
== Chargaff Eşitlik Kuralı 2 ==
Daha sonraki yıllarda bu kuralların her bir DNA ipliği için de doğru olup olmadığına bakılmıştır. Eğer yeterince uzun DNA dizilerine bakılırsa her bir DNA iplikçiği %A ~ %T ve %G ~ %C kuralının olduğunu bulunmuştur.<ref name=Rudner1968>Rudner R, Karkas JD, Chargaff E (1968). Separation of ''B. subtilis'' DNA into complementary strands. III. Direct Analysis. ''Proc Natl Acad Sci USA, 60:921-922''. {{PMID|4970114}}</ref> Chargaff'a atfen "Chargaff Eşitlik Kuralı 2" olarak adlandırılan bu kural tek bir DNA ipliğindeki baz bileşiminin global düzeyde bir özelliğidir, kısa DNA dizileri için geçerli değildir.<ref name="Zhang2003">{{Dergi kaynağı|yazar=Zhang CT, Zhang R, Ou HY |yıl=2003 |başlık=The Z curve database: a graphic representation of genome sequences |dergi=Bioinformatics |cilt=19 |sayı=5 |sayfalar=
== Kaynakça ==
47. satır:
== Ek okumalar ==
* {{Dergi kaynağı|yazar=Szybalski W, Kubinski H, Sheldrick P |yıl=1966 |başlık=Pyrimidine clusters on the transcribing strands of DNA and their possible role in the initiation of RNA synthesis |dergi=Cold Spring Harbor NY Symp. Quant Biol |cilt=31 |sayfalar=
* {{Dergi kaynağı|yazar=Lobry JR |yıl=1996 |başlık=Asymmetric substitution patterns in the two DNA strands of bacteria |dergi=Mol. Biol. Evol. |cilt=13 |sayı=5 |sayfalar=
* {{Dergi kaynağı|doi=10.1093/nar/27.7.1642 |yazar=Lafay B, Lloyd AT, McLean MJ, Devine KM, Sharp PM, Wolfe KH |yıl=1999 |başlık=Proteome composition and codon usage in spirochaetes: species-specific and DNA strand-specific mutational biases |dergi=Nucleic Acids Res |cilt=27 |sayı=7 |sayfalar=
* {{Dergi kaynağı|doi=10.1007/PL00006428 |yazar=McLean MJ, Wolfe KH, Devine KM |yıl=1998 |başlık=Base composition skews, replication orientation, and gene orientation in 12 prokaryote genomes |dergi=J Mol Evol |cilt=47 |sayfalar=
* {{Dergi kaynağı|doi=10.1073/pnas.95.18.10698 |yazar=McInerney JO |yıl=1998 |başlık=Replicational and transcriptional selection on codon usage in Borrelia burgdorferi |dergi=Proc Natl Acad Sci USA |cilt=95 |sayı=18 |sayfalar=
== Dış bağlantılar ==
|