Chargaff kuralları: Revizyonlar arasındaki fark

'''Chargaff kuralları''', Avusturyalı biyokimyacı [[Edwin Chargaff]] tarafından 1949-1951'de yayımlanan, [[DNA]]'daki çeşitli [[nükleobaz|azotlu bazların]] miktarları arasındaki ilişkileri ifade eden empirik kurallardır.<ref name="Elson1952">{{Dergi kaynağı|doi=10.1007/BF02170221 |yazar=Elson D, Chargaff E |yıl=1952 |başlık=On the deoxyribonucleic acid content of sea urchin gametes |journaldergi=Experientia |cilt=8 |sayı=4 |sayfalar=143–145 |pmid=14945441}}</ref><ref name="Chargaff1952">{{Dergi kaynağı|yazar=Chargaff E, Lipshitz R, Green C |yıl=1952 |başlık=Composition of the deoxypentose nucleic acids of four genera of sea-urchin |journaldergi=J Biol Chem |cilt=195 |sayı=1 |sayfalar=155–160 |pmid=14938364}}</ref><ref name="Chargaff1951a">{{Dergi kaynağı|yazar=Chargaff E, Lipshitz R, Green C, Hodes ME |yıl=1951 |başlık=The composition of the deoxyribonucleic acid of salmon sperm |journaldergi=J Biol Chem |cilt=192 |sayı=1 |sayfalar=223–230 |pmid=14917668}}</ref><ref name="Chargaff1951b">{{Dergi kaynağı|yazar=Chargaff E |yıl=1951 |başlık=Some recent studies on the composition and structure of nucleic acids |journaldergi=J Cell Physiol Suppl |cilt=38 |sayı=Suppl}}</ref><ref name="Magasanik1950">{{Dergi kaynağı|yazar=Magasanik B, Vischer E, Doniger R, Elson D, Chargaff E |yıl=1950 |başlık=The separation and estimation of ribonucleotides in minute quantities |journaldergi=J Biol Chem |cilt=186 |sayı=1 |sayfalar=37–50 |pmid=14778802}}</ref><ref name="Chargaff1950">{{Dergi kaynağı|doi=10.1007/BF02173653 |yazar=Chargaff E |yıl=1950 |başlık=Chemical specificity of nucleic acids and mechanism of their enzymatic degradation |journaldergi=Experientia |cilt=6 |sayı=6 |sayfalar=201–209 |pmid=15421335}}</ref>

Chargaff'ın kuralları, [[James Watson]] ve [[Francis Crick]]'ın önerdiği üç boyutlu DNA yapısının doğruluğunu destekleyici bir bilgi olarak belirtilmiştir.<ref name=FWPUB>{{Dergi kaynağı|yazar=Watson J.D. ve Crick F.H.C. |pmid=13054692 |doi=10.1038/171737a0 |url=http://www.nature.com/nature/dna50/watsoncrick.pdf |başlık=A Structure for Deoxyribose Nucleic Acid |journaldergi=Nature |cilt=171 |sayfalar=737–738 |yıl=1953 |biçim=PDF |sayı=4356}}</ref>

Aşağıdaki tablo Erwin Chargaff's 1952 verilerinden bazı örnekler sunar. Listelenmekte olan çeşitli organizmaların baz bileşimleri Chargaff'ın kurallarının desteklemektedir.<ref name="Bansal2003">{{Dergi kaynağı|yazar=Bansal M |başlık=DNA structure: Revisiting the Watson-Crick double helix |journaldergi=Current Science |cilt=85 |sayı=11 |sayfalar=1556–1563 |yıl=2003 |url=http://www.ias.ac.in/currsci/dec102003/1556.pdf}}</ref>

Daha sonraki yıllarda bu kuralların her bir DNA ipliği için de doğru olup olmadığına bakılmıştır. Eğer yeterince uzun DNA dizilerine bakılırsa her bir DNA iplikçiği %A ~ %T ve %G ~ %C kuralının olduğunu bulunmuştur.<ref name=Rudner1968>Rudner R, Karkas JD, Chargaff E (1968). Separation of ''B. subtilis'' DNA into complementary strands. III. Direct Analysis. ''Proc Natl Acad Sci USA, 60:921-922''. {{PMID|4970114}}</ref> Chargaff'a atfen "Chargaff Eşitlik Kuralı 2" olarak adlandırılan bu kural tek bir DNA ipliğindeki baz bileşiminin global düzeyde bir özelliğidir, kısa DNA dizileri için geçerli değildir.<ref name="Zhang2003">{{Dergi kaynağı|yazar=Zhang CT, Zhang R, Ou HY |yıl=2003 |başlık=The Z curve database: a graphic representation of genome sequences |journaldergi=Bioinformatics |cilt=19 |sayı=5 |sayfalar=593–599 |doi=10.1093/bioinformatics/btg041 |pmid=12651717}}</ref>

* {{Dergi kaynağı|yazar=Szybalski W, Kubinski H, Sheldrick P |yıl=1966 |başlık=Pyrimidine clusters on the transcribing strands of DNA and their possible role in the initiation of RNA synthesis |journaldergi=Cold Spring Harbor NY Symp. Quant Biol |cilt=31 |sayfalar=123–127}}

* {{Dergi kaynağı|yazar=Lobry JR |yıl=1996 |başlık=Asymmetric substitution patterns in the two DNA strands of bacteria |journaldergi=Mol. Biol. Evol. |cilt=13 |sayı=5 |sayfalar=660–665 |pmid=8676740}}

* {{Dergi kaynağı|doi=10.1093/nar/27.7.1642 |yazar=Lafay B, Lloyd AT, McLean MJ, Devine KM, Sharp PM, Wolfe KH |yıl=1999 |başlık=Proteome composition and codon usage in spirochaetes: species-specific and DNA strand-specific mutational biases |journaldergi=Nucleic Acids Res |cilt=27 |sayı=7 |sayfalar=1642–1649 |pmid=10075995 |pmc=148367}}

* {{Dergi kaynağı|doi=10.1007/PL00006428 |yazar=McLean MJ, Wolfe KH, Devine KM |yıl=1998 |başlık=Base composition skews, replication orientation, and gene orientation in 12 prokaryote genomes |journaldergi=J Mol Evol |cilt=47 |sayfalar=691–696 |pmid=9847411 |sayı=6}}

* {{Dergi kaynağı|doi=10.1073/pnas.95.18.10698 |yazar=McInerney JO |yıl=1998 |başlık=Replicational and transcriptional selection on codon usage in Borrelia burgdorferi |journaldergi=Proc Natl Acad Sci USA |cilt=95 |sayı=18 |sayfalar=10698–10703 |pmid=9724767 |pmc=27958}}