Chargaff kuralları: Revizyonlar arasındaki fark

'''Chargaff kuralları''', Avusturyalı biyokimyacı [[Edwin Chargaff]] tarafından 1949-1951'de yayımlanan, [[DNA]]'daki çeşitli [[nükleobaz|azotlu bazların]] miktarları arasındaki ilişkileri ifade eden empirik kurallardır.<ref name="Elson1952">{{Dergi kaynağı|doi=10.1007/BF02170221 |authoryazar=Elson D, Chargaff E |yearyıl=1952 |titlebaşlık=On the deoxyribonucleic acid content of sea urchin gametes |journal=Experientia |volumecilt=8 |issuesayı=4 |pagessayfalar=143–145 |pmid=14945441}}</ref><ref name="Chargaff1952">{{Dergi kaynağı|authoryazar=Chargaff E, Lipshitz R, Green C |yearyıl=1952 |titlebaşlık=Composition of the deoxypentose nucleic acids of four genera of sea-urchin |journal=J Biol Chem |volumecilt=195 |issuesayı=1 |pagessayfalar=155–160 |pmid=14938364}}</ref><ref name="Chargaff1951a">{{Dergi kaynağı|authoryazar=Chargaff E, Lipshitz R, Green C, Hodes ME |yearyıl=1951 |titlebaşlık=The composition of the deoxyribonucleic acid of salmon sperm |journal=J Biol Chem |volumecilt=192 |issuesayı=1 |pagessayfalar=223–230 |pmid=14917668}}</ref><ref name="Chargaff1951b">{{Dergi kaynağı|authoryazar=Chargaff E |yearyıl=1951 |titlebaşlık=Some recent studies on the composition and structure of nucleic acids |journal=J Cell Physiol Suppl |volumecilt=38 |issuesayı=Suppl}}</ref><ref name="Magasanik1950">{{Dergi kaynağı|authoryazar=Magasanik B, Vischer E, Doniger R, Elson D, Chargaff E |yearyıl=1950 |titlebaşlık=The separation and estimation of ribonucleotides in minute quantities |journal=J Biol Chem |volumecilt=186 |issuesayı=1 |pagessayfalar=37–50 |pmid=14778802}}</ref><ref name="Chargaff1950">{{Dergi kaynağı|doi=10.1007/BF02173653 |authoryazar=Chargaff E |yearyıl=1950 |titlebaşlık=Chemical specificity of nucleic acids and mechanism of their enzymatic degradation |journal=Experientia |volumecilt=6 |issuesayı=6 |pagessayfalar=201–209 |pmid=15421335}}</ref>

Chargaff'ın kuralları, [[James Watson]] ve [[Francis Crick]]'ın önerdiği üç boyutlu DNA yapısının doğruluğunu destekleyici bir bilgi olarak belirtilmiştir.<ref name=FWPUB>{{Dergi kaynağı|authoryazar=Watson J.D. ve Crick F.H.C. |pmid=13054692 |doi=10.1038/171737a0 |url=http://www.nature.com/nature/dna50/watsoncrick.pdf |titlebaşlık=A Structure for Deoxyribose Nucleic Acid |journal=Nature |volumecilt=171 |pagessayfalar=737–738 |yearyıl=1953 |formatbiçim=PDF |issuesayı=4356}}</ref>

Aşağıdaki tablo Erwin Chargaff's 1952 verilerinden bazı örnekler sunar. Listelenmekte olan çeşitli organizmaların baz bileşimleri Chargaff'ın kurallarının desteklemektedir.<ref name="Bansal2003">{{Dergi kaynağı|authoryazar=Bansal M |titlebaşlık=DNA structure: Revisiting the Watson-Crick double helix |journal=Current Science |volumecilt=85 |issuesayı=11 |pagessayfalar=1556–1563 |yearyıl=2003 |url=http://www.ias.ac.in/currsci/dec102003/1556.pdf}}</ref>

Daha sonraki yıllarda bu kuralların her bir DNA ipliği için de doğru olup olmadığına bakılmıştır. Eğer yeterince uzun DNA dizilerine bakılırsa her bir DNA iplikçiği %A ~ %T ve %G ~ %C kuralının olduğunu bulunmuştur.<ref name=Rudner1968>Rudner R, Karkas JD, Chargaff E (1968). Separation of ''B. subtilis'' DNA into complementary strands. III. Direct Analysis. ''Proc Natl Acad Sci USA, 60:921-922''. {{PMID|4970114}}</ref> Chargaff'a atfen "Chargaff Eşitlik Kuralı 2" olarak adlandırılan bu kural tek bir DNA ipliğindeki baz bileşiminin global düzeyde bir özelliğidir, kısa DNA dizileri için geçerli değildir.<ref name="Zhang2003">{{Dergi kaynağı|authoryazar=Zhang CT, Zhang R, Ou HY |yearyıl=2003 |titlebaşlık=The Z curve database: a graphic representation of genome sequences |journal=Bioinformatics |volumecilt=19 |issuesayı=5 |pagessayfalar=593–599 |doi=10.1093/bioinformatics/btg041 |pmid=12651717}}</ref>

* {{Dergi kaynağı|authoryazar=Szybalski W, Kubinski H, Sheldrick P |yearyıl=1966 |titlebaşlık=Pyrimidine clusters on the transcribing strands of DNA and their possible role in the initiation of RNA synthesis |journal=Cold Spring Harbor NY Symp. Quant Biol |volumecilt=31 |pagessayfalar=123–127}}

* {{Dergi kaynağı|authoryazar=Lobry JR |yearyıl=1996 |titlebaşlık=Asymmetric substitution patterns in the two DNA strands of bacteria |journal=Mol. Biol. Evol. |volumecilt=13 |issuesayı=5 |pagessayfalar=660–665 |pmid=8676740}}

* {{Dergi kaynağı|doi=10.1093/nar/27.7.1642 |authoryazar=Lafay B, Lloyd AT, McLean MJ, Devine KM, Sharp PM, Wolfe KH |yearyıl=1999 |titlebaşlık=Proteome composition and codon usage in spirochaetes: species-specific and DNA strand-specific mutational biases |journal=Nucleic Acids Res |volumecilt=27 |issuesayı=7 |pagessayfalar=1642–1649 |pmid=10075995 |pmc=148367}}

* {{Dergi kaynağı|doi=10.1007/PL00006428 |authoryazar=McLean MJ, Wolfe KH, Devine KM |yearyıl=1998 |titlebaşlık=Base composition skews, replication orientation, and gene orientation in 12 prokaryote genomes |journal=J Mol Evol |volumecilt=47 |pagessayfalar=691–696 |pmid=9847411 |issuesayı=6}}

* {{Dergi kaynağı|doi=10.1073/pnas.95.18.10698 |authoryazar=McInerney JO |yearyıl=1998 |titlebaşlık=Replicational and transcriptional selection on codon usage in Borrelia burgdorferi |journal=Proc Natl Acad Sci USA |volumecilt=95 |issuesayı=18 |pagessayfalar=10698–10703 |pmid=9724767 |pmc=27958}}