Oldukça büyük boyutundan dolayı, golgi aygıtı keşfedilip ayrıntılarıyla incelenen ilk organellerden biridir. Bu aygıt ilk defa 1897 yılında İtalyan [[tabip]] [[Camillo Golgi]] tarafından [[sinir sistemi]] üzerinde yapılan bir inceleme sonucu keşfedilmiştir.<ref name="pmid9865849"/> Bu organeli kendi [[Mikroskop|mikroskobunda]] ilk keşfinde yapıyı ''dahiliapparato ağsıreticolare aygıtinterno'' ([[İtalyancaTürkçe]]: ''apparatodahili reticolareağsı internoaygıt'') olarak adlandırdı. Bu yapının adı, keşfinden 1 yıl sonra Camillo Golgi'nin soyadıyla yeniden adlandırıldı. Ancak bazıları ilk başlarda keşiften şüphe duydu, bu yapının aslında sadece Golgi'nin gözlem tekniğinden kaynaklanan bir optik yanılsama olduğu iddia edildi. 20. yüzyılda modern mikroskopların gelişmesiyle keşif doğrulandı.<ref name="url_molexpress">{{cite web | url = http://micro.magnet.fsu.edu/cells/golgi/golgiapparatus.html | başlık = The Golgi Apparatus | author = Davidson MW | authorlink = | coauthors = | date = 2004-12-13 | format = | work = Molecular Expressions | publisher = Florida State University | pages = | language = | archiveurl = | archivedate = | quote = | accessdate = 2010-09-20 }}</ref>
