Su mikrobiyolojisi: Revizyonlar arasındaki fark

[kontrol edilmiş revizyon][kontrol edilmiş revizyon]
İçerik silindi İçerik eklendi
SpdyBot (mesaj | katkılar)
k →‎Moleküler metodlar: Bot: genel dz. ve madde bakımı (hata bildir)
k Anlam ayrımı sayfalarına verilen bağlantı asıl maddeye bağlandı
115. satır:
[[Toplam koloni sayımı]] veya diğer adıyla [[heterotrofik bakteri]] sayımı, organik besin maddeleri içeren bir ortamda, belli bir sıcaklık ve sürede üreyen tüm mikroorganizmaların sayılması anlamına gelmektedir.<ref name=":5">{{Akademik dergi kaynağı|url=https://linkinghub.elsevier.com/retrieve/pii/S0168160503004537|başlık=Heterotrophic plate count bacteria—what is their significance in drinking water?|tarih=2004|sayı=3|dil=İngilizce|sayfalar=265-274|çalışma=International Journal of Food Microbiology|cilt=92|ad=Martin J|soyadı=Allen|doi=10.1016/j.ijfoodmicro.2003.08.017|ad2=Stephen C|ad3=Donald J|soyadı2=Edberg|soyadı3=Reasoner|erişimtarihi=8 Nisan 2021|arşivurl=https://web.archive.org/web/20200816055616/https://linkinghub.elsevier.com/retrieve/pii/S0168160503004537|arşivtarihi=16 Ağustos 2020|ölüurl=hayır}}</ref> Yüksek olması tam anlamıyla bir kirlilik göstergesi olmasa da, su dağıtım sisteminin genel temizlik durumu ve bu durumdaki olası değişiklikler, yapılan dezenfeksiyon işleminin sudaki bakteri varlığına etkileri ve yeterliliği hakkında fikir verdiği düşünülmektedir.<ref name=":5" />
 
[[Koliform bakteri]]ler, ''[[Enterobacteriaceae]]'' familyasına üye pek çok [[cins]] ve [[tür]]ü kapsayan bir grubun genel adıdır ve en bilinen üyeleri ''[[Escherichia]]'', ''[[Enterobacter]]'', ''[[Klebsiella pneumoniae|Klebsiella]]'', ''[[Citrobacter]], [[Serratia]], [[Yersinia pestis|Yersinia]]'' ve ''[[Hafnia]]''’dır.<ref>{{Kitap kaynağı|url=https://www.worldcat.org/oclc/162677010|başlık=The handbook of water and wastewater microbiology|yazarlar=Nigel J.Horan|tarih=2003|editörler=D. Duncan Mara, N. J. Horan|bölüm=7 - Faecal indicator organisms|dil=İngilizce|sayfalar=105-112|yer=San Diego, Calif.|yayıncı=Academic|diğerleri=|isbn=978-0-12-470100-7|oclc=162677010}}</ref> Ortak özellikleri: [[Aerobik organizma|aerobik]] veya fakültatif aerobik, [[Gram negatif bakteri|Gram-negatif]], spor oluşturmayan, çubuk şekilli, oksidaz negatif olmaları ve [[laktoz]]u fermente edebilmeleridir.<ref>{{Akademik dergi kaynağı|url=https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0167701201003517|başlık=Detection and enumeration of coliforms in drinking water: current methods and emerging approaches|tarih=1 Mart 2002|sayı=1|dil=İngilizce|sayfalar=31-54|çalışma=Journal of Microbiological Methods|cilt=49|ad=Annie|soyadı=Rompré|issn=0167-7012|doi=10.1016/S0167-7012(01)00351-7|ad2=Pierre|ad3=Julia|ad4=Marie-Renée|ad5=Patrick|soyadı2=Servais|soyadı3=Baudart|soyadı4=de-Roubin|soyadı5=Laurent|erişimtarihi=8 Nisan 2021|arşivurl=https://web.archive.org/web/20120525090545/http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0167701201003517|arşivtarihi=25 Mayıs 2012|ölüurl=hayır}}</ref> Fekal kaynaklı olabilecekleri gibi, çevresel ortamdan kaynaklı da olabilirler. Çoğu patojen değildir. Su sistemlerinde tespit edilmeleri fekal kirlilik göstergesi sayılmaz. Ancak eğer sisteme koliformlar girebiliyor ve hayatta kalabiliyorsa, bu durum patojenlerin bakterilerin de girebileceği bir kontaminasyon kaynağının var olduğunu ve dezenfeksiyonun yetersiz olduğunu gösterir.<ref>{{Kitap kaynağı|url=https://www.worldcat.org/oclc/958385103|başlık=Twort's water supply|yazarlar=Malcolm J.Brandt, K.Michael Johnson, Andrew J.Elphinston, Don D.Ratnayaka|bölümurl=https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/B9780081000250000077|tarih=2016|editörler=Malcolm J. Brandt, K. Michael Johnson, Andrew J. Elphinston, Don D. Ratnayaka|bölüm=Chemistry, Microbiology and Biology of Water|dil=İngilizce|sayfalar=235-321|yer=Oxford, United Kingdom|yayıncı=Butterworth-Heinemann|seri=7th ed|diğerleri=|isbn=978-0-08-100043-4|oclc=958385103}}</ref>
'''Fekal kontaminasyon indikatörleri,''' insan ve [[Sıcakkanlı hayvanlar|sıcakkanlı hayvan]] dışkısı kökenli bakterilerin sularda bulunması fekal bir kontaminasyonu gösterir ve patojen mikroorganizmaların da büyük ihtimalle bulunabileceğine işaret eder.<ref name=":4" />
En yaygın kullanılan fekal indikatör ''E.coli''’dir. Koliform grubuna ait, gram (-) negatif, laktozu fermente eden ve tüm sıcakkanlı hayvan dışkılarında bulunan bir bakteridir. Su analizlerinde indikatör olarak tercih edilmesinin sebepleri:<ref name=":6">{{Akademik dergi kaynağı|url=http://doi.wiley.com/10.1111/j.1365-2672.2000.tb05338.x|başlık=Escherichia coli: the best biological drinking water indicator for public health protection|tarih=2000|sayı=S1|dil=İngilizce|sayfalar=106S-116S|çalışma=Journal of Applied Microbiology|cilt=88|ad=S.C.|soyadı=Edberg|doi=10.1111/j.1365-2672.2000.tb05338.x|ad2=E.W.|ad3=R.J.|ad4=M.J.|soyadı2=Rice|soyadı3=Karlin|soyadı4=Allen}}</ref>
185. satır:
 
==== Moleküler metodlar ====
Rutin su analizlerinde moleküler metotlar pek kullanılmazlar. Bunun başlıca nedenleri kullanılan cihaz ve ekipmanların yaygın bulunmayışı ve yüksek maliyetli oluşudur. Moleküler metotlar nükleik asitlerin [[hibridizasyonNükleik asit hibritleşmesi|hibridizasyonu]]u (çapraz eşleşme),  restriksiyonu (kesme), amplifikasyonu (kopyalayarak çoğaltma) ve sekanslaması (dizilim) gibi teknikleri kullanırlar.<ref name=":8" /> En bilinen yöntem [[Polimeraz zincir reaksiyonu|Polimeraz zincir reaksiyonudur (PCR)]].  Hedef mikroorganizmaya ait nükleik asit molekülünün [[DNA polimeraz]] enzimi ile amplifikasyonu prensibi ile çalışır.  Ayrıca [[Floresan in situ hibridizasyon|Floresan in situ hibridizasyon (FISH)]], Revers trankriptaz PCR, Laser scanning, DNA çipleri gibi bazıları yeni ortaya çıkmış pek çok farklı metot mevcuttur.<ref name=":8" />
 
==== Analiz Standartları ====