DNA süpersarımı: Revizyonlar arasındaki fark

DNA'nın "gevşemiş" çift sarmalında iki iplikçikiplik [[sarmal]] ekseni etrafında her 10,4-10,5 [[baz çifti]]nde bir tam dönüş yapar. [[İkili sarmal]]a burulma eklenmesi veya eksiltilmesi (bazı [[enzim]]ler tarafından yapılabildiği gibi), DNA'nın yapısına bir gerilim uygular. Eğer burulma gerilimi altında olan bir DNA parçasının iki ucu birleştirilerek bir halka ([[plazmit]] gibi) yaratılır ve sonra serbestçe hareket etmesine izin verilirse, halkasal DNA burkularak yeni bir şekil alır, örneğin 8 sayısı şekli gibi. Bu burkulmaya ''süpersarım'' veya süper sarılma (İng. ''supercoiling'') denir. Bu burkulmanın sonucu olarak DNA'nın bazı bölgelerinde molekül kendi etrafında sarılarak bir [[süpersarmal]] oluşturur.

Lk, düzlemsel bir izdüşümde (projeksiyonda) bir DNA iplikçiğinipliğin öbürünü kaç kere kestiğinin sayısıdır. DNA topolojisini tarif etmek için iki başka özelliğe değinilir. Tw, çift sarmalın burgu sayısıdır (Tw, İngilizce ''twist'', "burulma"nın karşılığıdır), Wr ise DNA'nın kaş kere kendi üzerine kat yaptığının sayısıdır (Wr, ingilizce ''writhe'', "burkulma"nın kısaltmasıdır). Kullanılan aşağıdaki denklemde Bağlantı sayısı, Tw ve Wr sayılarının toplamına eşittir. Halkasal bir DNA molekülünde (bir [[plazmit]] gibi) Tw ve Wr'nin toplamı, yani bağlantı sayısı sabittir, ama toplam aynı kalacak şekilde Tw ve Wr sayıları değişebilir.

Süpersarımlı DNA'nın bağlantı sayısı iki iplikçiğinipliğin birbirlerine sarılma sayısı olduğu için ''L'' değişemez. Halkasal bir DNA ikilisinin referans hali onun gevşemmiş halidir. Bu halde onun burkulma sayısı ''W'' = 0. ''L = T + W'' olduğu için gevşemiş halde ''T = L''. Dolayısıyla, örneğin, 400 bç gevşemiş halkasal bir DNA ikilisi halinde ''L ~ 40'' (B-DNA'da dönme başına ~10 bç varsayılırsa). O halde ''T ~ 40''.