[[Adolf Hitler]]'in Haziran 1941'de [[BarbarosaBarbarossa HarekatıHarekâtı|SSCB'yi işgalinin]] ana hedeflerinden biri Kafkas petrol sahalarına ulaşmaktı, ancak [[Mihver Devletleri|Mihver güçleri]]nin orduları hiçbir zaman Gürcistan'a ulaşamadı. Ülke, Kızıl Ordu'ya yaklaşık 700.000 asker (350.000'i hayatını kaybetti) sağladı ve hayati bir tekstil ve cephane kaynağıydı. Bu dönemde [[Josef Stalin]] (etnik bir Gürcü), [[Çeçen]], [[İnguş]], [[Karaçay]] ve [[Balkar]] halklarının Kuzey [[Kafkasya]]'dan sürülmesini emretti; [[Naziler]]le işbirliği yaptıkları iddiasıyla [[Sibirya]] ve [[Orta Asya]]'ya [[Sovyetler Birliği'nde sürgünler|nakledildiler]]. Özerk cumhuriyetleri kaldırıldı. Topraklarının bir kısmı 1957'ye kadar kısa süreliğine Gürcistan SSC'ye verildi.<ref>{{cite book |title= The Lesser Terror: Soviet State Security, 1939-1953|last= Parrish|first= Michael|year= 1996|publisher= Greenwood Publishing Group|isbn= 0-275-95113-8|pages= 102|url= https://books.google.com/books?id=NDgv5ognePgC&q=deportations+Chechens+Georgia+Klukhori&pg=PA102}}</ref>
