Moleküler tanıma: Revizyonlar arasındaki fark

[kontrol edilmiş revizyon][kontrol edilmiş revizyon]
İçerik silindi İçerik eklendi
Nanahuatl (mesaj | katkılar)
k düzeltme
Khutuck Bot (mesaj | katkılar)
k Kaynaklar ve referanslarda düzenleme
1. satır:
[[Dosya:Vancomysin AntimicrobAgentsChemother 1990 1342 commons.jpg|thumbnail|250px| L-Lys-D-Ala-D-Ala (bakteri hücre duvarı öncülü) kısa peptidinin vankomisin antibiyotiğine bağlanmış halinin kristal yapısı<ref>{{Dergi kaynağı|pmid=2386365 |month=July |yearyıl=1990 |last1soyadı1=Knox |first1ad1=James R. |last2soyadı2=Pratt |first2ad2=R. F. |titlebaşlık=Different modes of vancomycin and D-alanyl-D-alanine peptidase binding to cell wall peptide and a possible role for the vancomycin resistance protein |volumecilt=34 |issuesayı=7 |pagessayfalar=1342–7 |journal=Antimicrobial agents and chemotherapy |doi=10.1128/AAC. |url=http://aac.asm.org/cgi/reprint/34/7/1342}}</ref>]]
 
[[Dosya:Molecular Recognition ChemComm 1313 1998.jpg|thumbnail|250px|Hidrojen bağları ile bir konak moleküle bağlanmış iki izoftalik asit molekülü<ref>{{Dergi kaynağı|doi=10.1039/a707262g |titlebaşlık=A modular approach to constructing multi-site receptors for isophthalic acid |yearyıl=1998 |first1ad1=Christopher |last1soyadı1=Bielawski |first2ad2=Yuan-Shek |last2soyadı2=Chen |first3ad3=Peng |last3soyadı3=Zhang |first4ad4=Peggy-Jean |last4soyadı4=Prest |first5ad5=Jeffrey S. |last5soyadı5=Moore |journal=Chemical Communications |pagessayfalar=1313–4 |url=http://www.rsc.org/delivery/_ArticleLinking/DisplayArticleForFree.cfm?doi=a707262g&JournalCode=CC |formatbiçim=Free full text}}</ref></ref>]]
 
[[Dosya:Molecular Recognition Static vs Dynamic cartoon.png|thumbnail|250px|Bir misafir ile konak bağlanma yeri arasında statik tanıma. Dinamik tanıma bağlanmasında birinci bağlanma yerindeki birinci konuk, ikinci bağlanma yerindeki iki konuğun bağlanma sabitini etkiler. Bu örnekte pozitif alosterik sistem görülmektedir.]]
 
'''Moleküler tanıma''', iki veya daha çok molekül arasında [[kovalent olmayan bağ|kovalent olmayan bağlanma]] yoluyla ([[hidrojen bağı]], [[metal koordinasyonu]], [[hidrofobik kuvvet]]ler, [[van der Waals kuvveti|van der Waals kuvvetleri]], [[pi-pi etkileşimleri]], elektrostatik<ref>{{Dergi kaynağı|pmid=7851912 |yearyıl=1994 |last1soyadı1=Cosic |first1ad1=I |titlebaşlık=Macromolecular bioactivity: is it resonant interaction between macromolecules?—theory and applications |volumecilt=41 |issuesayı=12 |pagessayfalar=1101–14 |doi=10.1109/10.335859 |journal=IEEE transactions on bio-medical engineering}}</ref>) spesifik etkileşime değinmek için kullanılan bir terimdir. Moleküler tanımada konak ve konuk '''moleküler tamamlayıcılık''' gösterirler.<ref>{{Kitap kaynağı|ilk=Jean-Marie |son=Lehn | yıl=1995 | başlık =Supramolecular Chemistry | yer =Weinheim | yayımcı =Wiley-VCH |isbn=978-3-527-29312-4 |oclc=315928178}}</ref><ref>{{Dergi kaynağı|doi=10.1021/cr970328j |pmid=11851448 |yearyıl=1997 |last1soyadı1=Gellman |first1ad1=Samuel H. |titlebaşlık=Introduction: Molecular Recognition |volumecilt=97 |issuesayı=5 |pagessayfalar=1231–1232 |journal=Chemical reviews}}</ref>
 
== Biyolojik sistemler ==
16. satır:
Moleküler tanıma sistemleri ''statik moleküle tanıma'' ve ''dinamik moleküler tanıma'' olarak ikiye ayrılabilirler. Statik moleküler tanıma, bir anahtar ve kilit deliği arasındaki etkileşime benzetilir; bir konak molekülü ile bir konuk molekül arasında meydana gelen 1:1 tipli bir kompleksleşme tepkimesidir, bunun sonucu bir [[konak-konuk kimyası|konak-konuk kompleksi]] oluşur. Gelişkin statik moleküler tanıma elde etmek için spesifik konuk moleküller için tanıma yerleri oluşturmak gerekir.
 
Dinamik moleküler tanıma durumunda, birinci konuğun birinci bağlanma yerine bağlanması, ikinci konuğun ikinci bağlanma yeri için bağlanma sabitini etkiler.<ref>{{Dergi kaynağı|doi=10.1021/ar000177y |pmid=11412086 |yearyıl=2001 |last1soyadı1=Shinkai |first1ad1=Seiji |last2soyadı2=Ikeda |first2ad2=Masato |last3soyadı3=Sugasaki |first3ad3=Atsushi |last4soyadı4=Takeuchi |first4ad4=Masayuki |titlebaşlık=Positive allosteric systems designed on dynamic supramolecular scaffolds: toward switching and amplification of guest affinity and selectivity |volumecilt=34 |issuesayı=6 |pagessayfalar=494–503 |journal=[[Accounts of Chemical Research]]}}</ref> Pozitif alosterik sistemlerde birinci konağın bağlanması ikinci konağın bağlanma sabitini artırır. Buna karşın negatif alosterik sistemlerde bunun tersi olur, bağlanma sabiti azalır. Bu tip moleküle tanımanın dinamik özelliği önemlidir çünkü biyolojik sistemlerde bağlanmanın düzenlenmesi için bir mekanizma sağlar. [[Kimyasal sensor]] ve [[moleküler makina]] uygulamaları için dinamik moleküler tanıma üzerinde araştırmalar sürmektedir.
 
== Kaynakça ==