Ekim 1960'data Millî Birlik Komitesi 147 öğretim üyesini üniversitelerden uzaklaştırdı.<ref>{{Web kaynağı | url = http://www.milliyet.com.tr/default.aspx?aType=HaberDetay&ArticleID=500723 | başlık = "Nerede olduğu bilinmeyen “Timsah” ortaya çıktı" | erişimtarihi = 15 Haziran 2008 | yayımcı = Milliyet | tarih = 1 Mart 2008 | ilk = Filiz | son = Aygündüz | arşivurl = http://web.archive.org/web/20141129020541/http://www.milliyet.com.tr/default.aspx?aType=HaberDetay&ArticleID=500723 | arşivtarihi = 29 Kasım 2014}}</ref><ref name="Reformlar">{{Web kaynağı | url = http://egitim.aku.edu.tr/unireform3.ppt | başlık = Üniversite Reformları 1946-1982 | erişimtarihi = 15 Haziran 2008 | ilk = Necla | son = Tabak | arşivurl = http://web.archive.org/web/20101105045237/http://egitim.aku.edu.tr:80/unireform3.ppt | arşivtarihi = 5 Kasım 2010}}</ref> Görevine son verilenler arasında [[Ali Fuat Başgil]], [[Sabahattin Eyüboğlu]], [[Yavuz Abadan]], [[Nusret Hızır]], [[Tarık Zafer Tunaya]], [[Mina Urgan]], [[Haldun Taner]] de vardı. Genelde bu tasfiyeler üniversite içinden gelen ihbarlara dayanıyordu.<ref>{{Web kaynağı | url = http://www.radikal.com.tr/ek_haber.php?ek=ktp&haberno=7416 | başlık = "Timsah'ın Midesindekiler" | erişimtarihi = 15 Haziran 2008 | yayımcı = Radikal | tarih = 7 Mart 2007 | ilk = Gönül | son = Koca | arşivurl = http://web.archive.org/web/20141129023807/http://www.radikal.com.tr/ek_haber.php?ek=ktp&haberno=7416 | arşivtarihi = 29 Kasım 2014}}</ref> Kararı protesto etmek için [[Turhan Feyzioğlu]], [[Sıddık Sami Onar]], [[Fikret Narter]] ve [[Suut Kemal Yetkin]] gibi birçok rektör ve öğretim üyesi görevinden istifa etti.<ref>{{Web kaynağı | url = http://www.odtu.edu.tr/50yil/1960.php | başlık = 50. yıl bildirgesi | erişimtarihi = 15 Haziran 2008 | yardımcıyazarlar = Demirci; Didem | yayımcı = Orta Doğu Teknik Üniversitesi | ilk = Berrin Balay | son = Tuncer | arşivurl = http://web.archive.org/web/20091125172411/http://www.odtu.edu.tr:80/50yil/1960.php | arşivtarihi = 25 Kasım 2009}}</ref> 1962 yılında çıkarılan yasayla öğretim üyelerine üniversiteye geri dönüş hakkı tanındı.<ref name="Reformlar"/>
=== 55'ler olayı ===
{{ana|55'ler olayı}}
27 Mayıs Darbesi'nde [[Demokrat Parti (1946)|DP]]'liler ''Kürdistan Hükümeti tesis etmek'' üzere çalışmalar yapmakla suçlandılar.
<ref>{{Web kaynağı | url = http://www.bianet.org/bianet/kategori/bianet/107183/27-mayis-kurtler-ve-sark-islahat-plani-kararnamesi | başlık = 27 Mayıs, Kürtler ve Şark Islahat Planı Kararnamesi | erişimtarihi = 15 Haziran 2008 | yayımcı = Bianet | tarih = 26 Mayıs 2008 | ilk = Ümit | son = Fırat | arşivurl = http://web.archive.org/web/20080923230748/http://www.bianet.org:80/bianet/kategori/bianet/107183/27-mayis-kurtler-ve-sark-islahat-plani-kararnamesi | arşivtarihi = 23 Eylül 2008}}</ref><ref>{{Web kaynağı | url = http://arsiv.sabah.com.tr/2007/11/02/akoz.html | başlık = Menderes'in Kürt çözümü | erişimtarihi = 19 Mayıs 2010 | yayımcı = Sabah | tarih = 2 Kasım 2007 | ilk = Emre | son = Aköz | arşivurl = http://web.archive.org/web/20110920051646/http://arsiv.sabah.com.tr/2007/11/02/akoz.html | arşivtarihi = 20 Eylül 2011}}</ref><ref>{{Web kaynağı | url = http://www.marksisttutum.org/27mayis60.htm | başlık = Türkiye'deki askeri darbeler gerçeğine kısa bakış | erişimtarihi = 19 Mayıs 2010 | yayımcı = Marksisttutum | tarih = 2 Kasım 2007 | ilk = Elif | son = Çağlı | arşivurl = http://web.archive.org/web/20140723062130/http://marksisttutum.org/27mayis60.htm | arşivtarihi = 23 Temmuz 2014}}</ref> 31 Mayıs 1960'data [[Cumhuriyet (gazete)|''Cumhuriyet'']] gazetesinde MBK'nin bu konuyla ilgili çeşitli belgeler bulduğu ve [[Şeyh Said]]'in oğlunun DP iktidarı döneminde doğuda propaganda gezileri yaptığı iddia edilmiştir.<ref>{{Web kaynağı | url = http://ieylem.wordpress.com/2007/01/22/111/ | başlık = Kürt sorununda gizli kalmış milat | erişimtarihi = 15 Haziran 2008 | yayımcı = Nokta | ilk = Nevzat | son = Çiçek | arşivurl = http://web.archive.org/web/20140221192049/http://ieylem.wordpress.com:80/2007/01/22/111/ | arşivtarihi = 21 Şubat 2014}}</ref> Darbeden 4 gün sonra Doğu ve Güneydoğu'dan seçilen 485 ağa ve şeyhler [[Sivas]] Garnizonu (Kabakyazı)'nda bir kampa yollanmıştır.
<ref>{{Web kaynağı | url = http://www.haberaktuel.com/news_detail.php?id=53766&uniq_id=1213789982 | başlık = 485 Kürt'e 27 Mayıs'ta ne oldu? | erişimtarihi = 15 Haziran 2008 | yayımcı = HaberAktüel | arşivengelli = evet}}</ref><ref>{{Web kaynağı | url = http://www.savaskarsitlari.org/arsiv.asp?ArsivTipID=5&ArsivAnaID=37333 | başlık = Kürt sorununun gizli tarihi | erişimtarihi = 19 Mayıs 2010 | yayımcı = Birgün | tarih = 18 Ocak 2007 | arşivurl = http://web.archive.org/web/20091120225208/http://www.savaskarsitlari.org:80/arsiv.asp?ArsivTipID=5&ArsivAnaID=37333 | arşivtarihi = 20 Kasım 2009}}</ref> Bu konu hakkında [[Cemal Gürsel]]'in ''"ileri gelen 2500 Kürdü öldürelim"'' dediği iddia edilmektedir.<ref>{{Dergi kaynağı
|son=Korkmaz
595. satır:
MBK üyelerinden [[Muzaffer Yurdakuler]], Seyhan tasfiye kararını arkadaşlarına anlatırken kulak misafiri olmuş ve diğer MBK üyelerine haber vermiştir.
Karşı taraf erken davranmış ve Gürsel [[13 Kasım]] [[1960]]'data Alparslan Türkeş'e bir mektup göndererek Kurmay Albay [[Alparslan Türkeş]], Kurmay Yarbay [[Orhan Kabibay]], Kurmay Yarbay [[Mustafa Kaplan (siyasetçi)|Mustafa Kaplan]], Kurmay Binbaşı [[Orhan Erkanlı]], Kurmay Binbaşı [[Şefik Soyuyüce]], Kurmay Binbaşı [[Dündar Taşer]], Piyade Binbaşı [[Fazıl Akkoyunlu]], Tank Binbaşı [[Muzaffer Karan]], Deniz Kurmay Binbaşı [[Münir Köseoğlu]], Deniz Kıdemli Yüzbaşı [[Rıfat Baykal]], Kurmay Yüzbaşı [[İrfan Solmazer]], Kurmay Yüzbaşı [[Numan Esin]], Kurmay Yüzbaşı [[Muzaffer Özdağ]] ve Jandarma Yüzbaşı [[Ahmet Er]] olmak üzere çoğunluğu ''Türkçü'' subaydan oluşan 14 MBK üyesini emekliliğe sevkedip yurtdışındaki temsilciliklere danışman olarak tayin etmiştir.<ref name="Bay Pipo" />
