Gen Ontolojisi: Revizyonlar arasındaki fark
[kontrol edilmiş revizyon] | [kontrol edilmiş revizyon] |
İçerik silindi İçerik eklendi
By erdo can (mesaj | katkılar) k →Kaynaklar: Kaynakça düzenlemesi AWB ile |
Teacher0691 (mesaj | katkılar) |
||
51. satır:
==Araçlar==
GO projesinin sağladığı verileri kullanan, hem çevrimiçi hem de indirerek kullanılabilecek çok sayıda araç bulunmaktadır<ref name="pmid18480123">{{Dergi kaynağı | author = Mosquera JL, Sánchez-Pla A | title = SerbGO: searching for the best GO tool | journal = Nucleic Acids Res. | volume = 36 | issue = Web Server issue | pages = W368–71 |date=July 2008 | pmid = 18480123 | pmc = 2447766 | doi = 10.1093/nar/gkn256 }}</ref>. Bunların muazzam
'''AmiGO'''<ref>{{cite doi|10.1093/bioinformatics/btn615}}</ref>, kullanıcıların ontolojileri ve gen ürünü notlama verilerini sorgulamasına, taramasına ve görselleştirmesine olanak veren web-tabanlı bir uygulamadır. Ayrıca, bir [[BLAST]] aracı,<ref>[http://amigo.geneontology.org/cgi-bin/amigo/blast.cgi AmiGO BLAST aracı]</ref> daha büyük veri kümelerinin analizine olanak veren araçları,<ref>[http://amigo.geneontology.org/cgi-bin/amigo/term_enrichment AmiGO Terim Zenginleşim aracı]; bir notlama kümesinde paylaşılan belirgin GO terimlerini bulur</ref><ref>[http://amigo.geneontology.org/cgi-bin/amigo/slimmer AmiGO İnceltici]; granüler notlamaları üst-düzey terimlere kadar eşleştirir</ref> ve GO veritabanını doğrudan sorgulamak için bir arayüzü de bulunur.<ref>[http://berkeleybop.org/goose GOOSE], GO Çevrimiçi SQL Ortamı; GO veritabanına dönük doğrudan SQL sorgulamasına olanak verir</ref>
|