Zünnûn-ı Mısrî, [[tarikat]] üyeliğine yeni kabul edilmiş olan mürid ile [[tarikât]]ın [[şeyh]]i veya [[mürşid]]i ile arasındaki iletişimin kolaylaşmasına yardımcı olacak bir sistem geliştirmek suretiyle [[Marifetullah]] İrfân/Gnosis öğretisini biçimlendirdi.
==="Fenâ Fî’Allah" ve "Bekâ Bî’Allah" mertebeleri, Murakabe, Keşf, İlhâm konularında yaptığı çalışmalar===
{{ana|Letaif|Keşf|İlham|Fenafillah|Murakabe}}
Zünnun, sonradan tasavvufun temel kuramları durumuna gelen [[Fenafillah|fenâ]] (Tanrı'nın varlığında yok olma), [[Murakabe|bekâ]] (Tanrı'nın varlığında var olma), [[keşf]] ve ilham gibi konular üzerinde ilk duran [[mutasavvıf]]lardandır. Buna karşılık [[Kur'an]] ve [[Sünnet (din)|sünnet]]e bağlılıktan da ödün vermemiştir. Tanrı'yı Tanrı'nın bilgisiyle, Tanrı dışındaki varlıkları da peygamberlerinin bilgisiyle tanıdığını söyleyen Zünnûn'a göre Tanrı'yı seven ya da peygamberini izleyen, ahlakında, eylem ve davranışlarda ona uyandır. Ruhun yetkinleşmesi için acı çekmek gerekir. Acı müminin tuzudur; tuz olmadığında mümin çürür gider. İnsanın mutluluğu da "Sevgili"nin gönderdiği acılara bağlıdır.
