Babası [[Melikşah]]’ınoğludurannesi cariye kökenli Taceddin Seferiyye Hatun'dur.<ref>TDV İslam Ansiklopedisi, cilt: 43, sayfa: 84</ref> Babasının bir seferi sırasında, [[1086]] yılında [[Sincar]]’da doğdu. Babası öldüğünde 1092'de henüz küçüktü. Melikşah'ın ölmesi ile Büyük Selçuklu Devleti bir anarşi içine girdi. Melihşah'ın eşi Terken Hatun, Melikşah'ın kücük yaştaki oğlu ve Sencer'in kardeşi [[I. Mahmud (Selçuklu)|I. Mahmud]]'un sultanlığını ilan etti. Melihşah'ın büyük oğlu olan [[Berkyaruk]] taraftarları tarafından [[Rey]] şehrine kaçırılıp Sultan ilan edildi ve Berkyaruk ve I. Mahmud güçleri arasında 17 Ocak 1093 Burûçird'de yapılan savaşta Berkyaruk galip geldi. Ahmet Sencer ve Berkyaruk'un amcası olan [[Tutuş (Selçuklu)|Tutuş]] Suriye'ye ilerliyerek [[Şam]] ve [[Halep]] şehirlerini eline geçirip [[Suriye Selçuklu Devleti]]'nin kurucusu oldu. Tutuş Berkyaruk elinde bulunan İran arazilerini de ele geçirmek üzere Berkyaruk'a hücum etti ise de 26 Şubat 1095'de [[Rey, İran|Rey]]'de Berkyaruk ile Tutuş arasında yapılan savaşta Tutuş yenildi ve öldü. Böylece Berkyaruk tek Sultan oldu ama zamn zaman ya kardeşleri ya da onların varislerinin ayaklanmaları tehditleri veya gerçekleşmeleri ile karşılaştı. Bundan sonra Büyük Selçuklu Devleti üçe bölünmüş olarak görülmeye başlandı:
* İran, Irak ve Orta Asya'nın bir kısmı Berkyaruk'un sultanlığı altında
* Suriye'de [[Tutuş (Selçuklu)|Tutuş]]'un iki oğlu idaresi altında Şam Melikliği ve Halep Melikliği;
