[[Dosya:Jan2 Alexios1.jpg|thumb|left|II. Yannis ve en büyük oğlu Aleksios, [[İsa]] tarafında tac giydiriliyorlar]]
Karısının kimliği belirsizdir. Muhtemelen iki kere evlenmiştir, ilki [[Kiev]]li I. Mstislav'ın kızı Dobrodjeja Mstislavna ve ikincisi [[Gürcistan]]lı IV. David'in kızı Katay'dır. Her iki kadının [[Komnenos hanedanı]] ile evlendiği kesindir. Ancak koca ya da kocalarının kim olduğu konusunda birçok teori vardır.<ref>[http://fmg.ac/Projects/MedLands/BYZANTIUM%2010571204.htm#AlexiosKdied1142 Profile of Alexios Komnenos and his daughter in "Medieval Lands" by Charles Cawley]</ref> Kızı Maria Komnene, ''pansebastos'' [[Aleksios AxouchAksuh]] ile evlenmiştir. Aleksios, II. Yannis'in yakın arkadaşı olan ''[[Megas Domestikos]]'' ("Bizans Ordusu komutanı") [[Yannis AxouchAksuh]]'un oğludur.<ref>Choniates p.59</ref> Aleksios AxouchAksuh, [[Klikya]] dükü ve ''protostrator'' olarak hizmet etmiştir.<ref name="fmg.ac">[http://fmg.ac/Projects/MedLands/BYZANTINE%20NOBILITY.htm#_Toc178348366 Profile of the Axuches family in "Medieval Lands" by Charles Cawley]</ref> Fakat 1167 yılında [[I. Manuel Komnenos]] ile ters düşmüştür. [[John Kinnamos]] ve [[Niketas Honiates]], [[cadı]]lık eylemleri dahil suçlamalarda bulunulduğunu raporlamışlardır. O ve adı günümüze ulaşmamış [[Latinler|latin]] bir cadı, imparator karısı [[Antakyalı Maria]]'nın düşükle sonuçlanan hamile kalmasına neden oldukları nedeniyle suçlanmışlardır. Bunu Maria'ya hap vererek yaptıkları belirtilmiştir.<ref>[http://www.roman-emperors.org/maryant.htm Lynda Garland and Andrew Stone, "Mary of Antioch"]</ref> Aleksios hayatını keşiş olarak bitirmiştir.<ref name="fmg.ac"/> Aleksios AxouchAksuh'un karısı Maria Komnene'nin bu olay nedeniyle damgalandığı söylenir. Maria, hayatın sonunu akıl hastalığından muzdarip geçirmiştir.<ref>Mihail-Dimitri Sturdza, ''Dictionnaire historique et Généalogique des grandes familles de Grèce, d'Albanie et de Constantinople'' (1983), p. 276.</ref>
Maria Komnene ve Aleksios AxouchAksuh çifti, kısa bir süre imparator [[III. Aleksios Angelos]]'a karşı kısa bir süre iktidara gelen "Şişman" [[Yannis Komnenos (şişman)|Yannis Komnenos]]'un ebeveynidir. [[Trabzon İmparatorluğu]]'nun ilk imparatoru [[Trabzonlu I. Aleksios Komnenos]]'un karısı [[Theodora Axuchina]] muhtemelen Şişman Yannis'in kızıdır.<ref name="fmg.ac"/>
