Ninkilim Mezopotamya mitolojisinde fare ve haşarat tanrıçasıdır.

Çiftçi yıllığı adı verilen Sümer metninde çiftçiden, fare ve haşarat tanrıçası Ninkilim'e yetişen ürünlere zarar vermemeleri ve aynı zamanda kuşları da korkutup kaçırması için dua etmesi istenir.